ความชุกของโรคภูมิคุ้มกันทำลายตนเองกำลังเพิ่มขึ้น และแม้ว่าพันธุกรรมจะมีบทบาท แต่การเพิ่มขึ้นอย่างรวดเร็วนี้ส่วนใหญ่เกิดจากวิถีชีวิตสมัยใหม่และปัจจัยด้านสิ่งแวดล้อม การเปลี่ยนแปลงในอาหาร การบริโภคอาหารแปรรูปที่เพิ่มขึ้น และสุขภาพลำไส้โดยรวมที่ลดลงเป็นปัจจัยสำคัญที่ส่งผลต่อภาวะนี้ ปัจจัยเหล่านี้มักนำไปสู่ภาวะลำไส้รั่ว (leaky gut) ซึ่งเยื่อบุลำไส้ยอมให้สารต่างๆ ที่ควรถูกกักอยู่ในทางเดินอาหารผ่านเข้าสู่กระแสเลือด ทำให้เกิดการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกัน.